Суть проблемы - по ссылкам вида cms-joomla.ru/content/view/853/4/ редиректилось на cms-joomla.ru/?task=view и т.д. В общем, бред.

Но sh404SEF умеет редиректить с НЕ-SEF ссылок на свои SEF-ссылки. Осталось подсунуть ему эти ссылки, преобразовав SEF-ссылки Joomla 1.0 в НЕ-SEF-ссылки Joomla 1.5 (тяжело наверно такое читать :)).

Решение:

Добавляем в файл .htaccess сразу после строки включения mod_rewrite

RewriteEngine On

следующие строки (приведены не все возможные строки):

RewriteRule ^content/view/([0-9]+)$ http://cms-joomla.ru/index.php?option=com_content&view=article&id=$1 [L]
RewriteRule ^content/view/([0-9]+)/$ http://cms-joomla.ru/index.php?option=com_content&view=article&id=$1 [L]

RewriteRule ^content/view/([0-9]+)/([0-9]+)$ http://cms-joomla.ru/index.php?option=com_content&view=article&id=$1&Itemid=$2 [L]
RewriteRule ^content/view/([0-9]+)/([0-9]+)/$ http://cms-joomla.ru/index.php?option=com_content&view=article&id=$1&Itemid=$2 [L]

RewriteRule ^content/category/([0-9]+)/([0-9]+)/([0-9]+)$ http://cms-joomla.ru/index.php?option=com_content&view=category&sectionid=$1&id=$2&Itemid=$3 [L]
RewriteRule ^content/category/([0-9]+)/([0-9]+)/([0-9]+)/$ http://cms-joomla.ru/index.php?option=com_content&view=category&sectionid=$1&id=$2&Itemid=$3 [L]

RewriteRule ^content/blogsection/([0-9]+)/([0-9]+)/$ http://cms-joomla.ru/index.php?option=com_content&view=section&ayout=blog&aid=$1&Itemid=$2 [L]

Остальное можно сделать по аналогии. Если sh404SEF будет правильно настроен, то старые ссылки 301 редиректом должны вести на новые SEF-ссылки, созданные в sh404SEF.